Die Konferenz bestimmt aus den Dachorganisationen diejenigen Organisationen, die neben den beiden Trägerorganisationen im Lenkungsausschuss vertreten sind.

Der Vorsitzende der Konferenz führt auch den Lenkungsausschuss.

Der Lenkungsausschuss setzt sich aus fünf Vertretungen der Konferenz zusammen. Er erarbeitet die Grundlagen für die Konferenz und stellt die Umsetzung der gemeinsam definierten Ziele sicher.

Der Lenkungssausschuss stützt sich auf das Expertenwissen der teilnehmenden Organisationen. Über den Beizug und die Finanzierung externer Fachexpertinnen bzw. Fachexperten entscheidet die Konferenz.

Auf Anfrage der übrigen Verbundpartner bestimmt der Lenkungsausschuss Delegierte aus der Konferenz in eidgenössische Kommissionen und Arbeitsgruppen. Dies erfolgt jeweils nach Rücksprache mit den teilnehmenden Organisationen.